由著名导演于立清执导大型抗日题材剧《血色玫瑰2之女子别动队》讲述的是龙虎山抗日游击支队女子别动 队，如何与日本人进行浴血奋战，并最终粉碎了敌人的细菌战的故事。 1939年抗日战争进入相持阶段，  海报为了有效地消灭和牵制日本特务机关及为日本效命的汉奸势力，以共产党员陆玫为首的别动队深入敌后。 这支别动队先后完成了夺取藏宝图、截获“731”细菌样品、保护国家文物、运出盘尼西林、夺取特高科密码本、营救重要人物等等异常艰难的任务，为抗日民族统一大业立下了不可磨灭的功勋。而别动队员们不同的身份、不同的经历和不同的性格也使他们之间出现很多感情上的纠葛。 民族大义和私人仇怨的撞击；爱国情结和男女之情的纠缠；国共合作和黑白两道的复杂形势，使故事精彩纷呈。

1942年，日本侵略者对重庆的大轰炸已经进入了第四个年头。侵华日军总司令冈村宁次意外的得到一个情报：在重庆西南的古刹华岩寺中藏有一件镇寺之宝--《贝叶金经》，在这部经书中还隐藏了一个惊天秘密。如果得到了这个秘密就可以让日军轻而易举的消灭整个国民党政府，以实现其占领全中国的狼子野心。为了得到《贝叶金经》，冈村宁次精心策划了一次代号“阿波罗”的作战行动，他特别派遣了由日本浪人组成的，日军王牌特工队“樱花小组”秘密潜入重庆，偷偷的把黑手伸向了西南第一古刹--华岩寺。通过各种渠道得知日军特工潜入重庆的消息后，为了粉碎日寇的阴谋，中共地下党组织、国民党中的爱国人士与华岩寺众僧侣与“樱花小组”展开了殊死搏斗，最后他们用鲜血和生命终于将《贝叶金经》完好无损的保护了下来。1942年，抗日战争进行到了非常艰苦的僵持阶段。日寇飞机对国民党中央政府的陪都重庆进行疯狂大轰炸已经是第四个年头了。刚刚得到天皇嘉奖的侵华日军总司令冈村宁次，意外获知了一个可以轻而易举消灭国民党中央政府的秘密，并已根据这个情报制定了代号“阿波罗”的详细计划。而且冈村宁次还亲自挑选了，代号“樱花小组”的特工小组，来完成这一计划。“樱花小组”是日军最王牌的特工行动小组。它的成员包括：光、明子、美亚和阿之四个年轻貌美的女孩子，还有一个总是黑纱罩面的小组首脑--“樱花一号”：藤原爱，她的另一重身份是天皇御妹！樱花小组这次的任务，是要到重庆市郊的古刹“华岩寺”里，盗取那儿的镇寺之宝《贝叶金经》1942年的一天，在重庆国民党军统局，局长办公室里，军统局长戴笠看着刚刚截获的一封日军密电，不知为什么，他预感到正有一场血雨腥风就要在自己身边爆发！这天，日寇飞机突然一改重点轰炸重庆市区的惯例，而是把炸弹扔在了重庆郊外的西南第一古刹“华岩寺”周围。这时惊慌逃散的人群中有一位衣着雅致端庄的中年夫人不停的大喊：“不要乱跑，快趴下！”并把一个孩子挡在身下，这时候一颗炸弹在她身边爆炸了。这位夫人被方丈怀空大师救起。原来她是东北军抗日将领解望东将军的遗孀施绪萍，从东北逃难至此，现在住在山脚下帮寺里浆洗衣物干杂活为生的柳氏、小叶子母女家。施夫人谢绝了怀空大师让她留在寺中调养的好意，带着丫鬟小凤回到了山脚下暂住的小叶子家。日本人这次不寻常的轰炸引起了“华岩寺”上下的警觉，怀空大师怀疑日本人是想偷镇寺之宝《贝叶金经》，并嘱咐爱徒赵云龙和智青严加防范。戴笠来到华岩寺，转达了蒋介石想在观音诞日来华岩寺作一场“护国息灾大法会”的事，怀空大师答应了下来。一天深夜，云龙和智青在大雄宝殿抓到一个偷东西的贼。经审问，那贼居然是想来投《贝叶金经》。得知经书没有丢失后，怀空大师为免多生事端，名众人将贼放走。那贼刚出山门不远便被一黑衣人一刀杀死。

故事发生在抗日战争初期。国军中校马烽（宋佳伦 饰）奉命组建“025敢死队”，以伺机袭击南京城内的日寇，他从被即将行刑的死囚中挑选了五个他认为合格的队员，他们是苏维埃政府军械部长麻老五（韩童生 饰）、中情局特工徐飞虎（杨猛 饰）、飞贼唐人杰（郭铁城 饰）、以及强大龙（铁鹤 饰）和朱大山。经过严格布置后，马烽带他们进入日寇铁蹄下的南京城，成功营救出两名援华的美国医生，并保护了他们所拍摄的南京大屠杀胶片。之后，他们冒着极大风险，成功刺杀日军驻南京最高指挥官熊本连太郎，并夺回国宝——传国玉玺。最后，他们为给殉难的三十万同胞复仇，决定在日军高官开会时与敌人同归于尽……