因人体实验成为改造人类的キサラギ，正被一个组织追击。　　这个组织是企图征服被分割的“东京”的不死吸血鬼团体“不死骑士团”。　　发誓为死去的头目复仇的黑帮成员们也加入了追捕，形势升级为多方对抗。　　“原本没有理由活下去，但也没有理由被这些家伙杀掉──”　　运用改造过的身体中嵌入的各种武器和自己特殊的“血”，キサラギ地狱般的逃生大作战开始！！！

在播磨，武藏一行遇见了上杉龙臣统领的大型武士团——上杉武士团。他们的目的是讨伐盘踞在淡路岛的巨大鬼神“炮战龙八岐大蛇”。在那里，还有武田尚虎率领的武田武士团，与武藏同龄的武士岛津秋弘、尼子胜巳，以及稍显不通世俗的腼腆公主猿渡满等人。　　在各种想法翻涌的涡旋之中，武藏一行也加入了灭鬼的战斗。而他们要挑战的八岐大蛇，则是号称“从未被人伤及分毫”、铜墙铁壁般的鬼神。武藏和同伴们将要面对的，是一场前所未有的激战。

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