曾经，一场可怕而又残酷的战争使整个大陆满目疮痍生灵涂炭，这场战争亦使“恶魔契约”成为了禁忌的代名词，从此成为历史，被封印在了滚滚的时间洪流之中。一晃眼多年过去，人们终于迎来了和平年代，瑟希莉（藤村步 配音）作为旧日贵族，如今的自卫骑士团少女，守护着父亲留给她的古剑，寻找着将其再度锻造的契机。　　某日，瑟希莉在一场意外之中发现拥有强大魔力的“恶魔契约”重现世间，与此同时，一位名叫路克（冈本信彦 配音）的男子，则用他神秘的佩剑，轻易破解了这强大的力量，巧合的是，路克正在经营一间锻造店。想要锻造宝剑的少女，遇见了经营着锻造店的少年，当两人相遇，命运的车轮开始了转动。

　　本作品的出场人物，大部份取自格林童话里的人物。这些人物在本作中，作了大幅度的整理，让每一个童话人物一看就知道是哪一个人物。　　故事的男主角铃风草太，是一个中学生。一直以来，他都很想探求小时候母亲说过的一个童话故事。有一天，草太在耳边隐约听到一把神秘的声音，正在说着这故事的内容。他这把声音引诱到秋叶原的小巷中。草太就是这样，遇到一个称他为“艾尔岱之钥”的男人。这男人突然变身为恶梦魔，对草太施以袭击。在电光火石间，一只会说话的狼救了草太，并与一个戴着红色头盔的神秘少女会合，把恶梦魔击退。这个少女，就是四叶骑士团成员、三枪士之一——小红帽。小红帽从魔法世界范达威利，来到现实世界艾尔岱，目的就是要保护草太，以免他落入企图侵略艾尔岱世界的邪恶魔女桑德利永手中。他们在范达威利经历了很多冒险，最后由三枪士、威尔、哈梅林、汉泽尔兄妹，化成七贤者，再次封印桑德利永。

市立见泷原中学，又迎来平静祥和的一天。就读于二年级的女孩鹿目圆（悠木碧 配音）和朋友美树沙耶加（喜多村英梨 配音）、志筑仁美（新谷良子 配音）尽情讨论恋爱的话题，享受少女的快乐青春。这时班上转来了名叫晓美焰（斋藤千和 配音）的新生，这个带着些许神秘气质的女孩让小圆颇感疑惑。与沙耶加下学回家路上，小圆听到呼救声，声音来自一只浑身伤痕累累的未知生物，而追杀它的正是晓美焰。危急时刻，她们得到同为见泷原中学学生的魔法少女巴麻美（水桥香织 配音）的帮助，进而得知那只名叫丘比的生物有能够帮助人变成魔法少女的能力。少女们无意间开启了通往另一个世界的大门……　　本片为魔法少女的剧场版，分三部上映，由TV版12话重新编集而成。

柔泽十（细谷佳正 配音）是一个外表凶恶的金发不良少年，但在内心里，十对自己的个性和所作所为十分厌恶。某一天，十突然被一个自称与他有着前世羁绊的叫做堕花雨（広桥凉 配音）的诡异少女缠上了。雨是一个标准的电波女，喜欢漫画和手办，常年用刘海遮住脸孔。对于雨的强烈攻势，十一开始十分抗拒，但随着雨的锲而不舍，十渐渐接受了雨神出鬼没的存在。　　说来也怪，自从雨出现后。在十的身边开始发生一些诡异残酷的连续杀人事件，而解决事件的线索均指向了行为怪异的雨，这让十不得不开怀疑其雨的身份来。随着调查的深入，十发现，真相果然与雨有着千丝万缕的联系，而其中蕴藏着的，是有关人扭曲人性的悲哀的故事。

故事发生在从10年前发生了的“同时多发无气力症”的灾难中恢复的未来型新兴城市绫风市。相隔10年之久，高中生神乡慎与弟弟洵在绫风市遇到了担任绫风市警察署长的哥哥谅。　　而这个时候，在绫风市正发生了各种各样的怪异事件。作为警察署长的神乡谅一直在追查着潜藏在这一连串怪异事件背后的神秘组织。而被卷入某件事件的神乡慎“persona”能力和形态觉醒过来。兄弟们的命运的齿轮现在开始转动……。