影片背景设置在11世纪的波斯，一位英国人为了学习医术掩盖其天主教徒的身体，加入了伊斯巴罕一所只招收犹太人的医学院。他治随的老师名叫阿维森纳，是历史上著名的犹太科学家、思想家和医生。阿维森纳的著作达200多种，最著名的有《哲学、科学大全》，在当时是高水平的百科全书；另一部 巨著是《医典》，直到17世纪西方国家还视为医学经典，至今仍有参考价值。《神医》结合史诗与虚构，展现了在那个被愚昧和迷信统治的世纪里一群人探索真知的无畏精神。

麦克（诺拉·茨切纳 Nora Tschirner 饰）是一位非常平凡的，生活在德国西部的小镇女孩，每天都重复着昨日的生活，这令她感到十分的无聊。麦克有一个梦想，那就是购买一辆越野车，在撒哈拉沙漠疯狂的飙车。 一天，麦克参加了海关组织的拍卖会，在拍卖会上，她以意外便宜的价格买下了一辆吉普车，让麦克没有想到的是，她竟然在吉普车里发现了50公斤的可卡因。这意外的毒品彻底改变了麦克的生活，它们本来的主人也为了找回它们而展开了对于麦克的追捕行动。在此过程中，麦克结识了名为萨利姆（埃利亚斯·穆巴里克 Elyas M'Barek 饰）的男孩。