话说故事发生在五百年前的大明朝，巍巍京师，人头攒动，摩肩接踵，好一派盛世繁华的景象。在京城一隅经营着一家天和医馆，馆主陈幕禅（杨皓宇 饰）以专治疑难杂症而享誉京城，但是他却有一个不为人知的身份，那就是西厂的特务。某天，陈幕禅突然失踪，志愿成为御医的学徒朱一品（陈赫 饰）得到一个关系重大的卷轴。家庭变故让大小姐陈安安（张子萱 饰）伤心不已，而卷轴的出现则让一品、师兄弟赵布祝（佟磊 饰）、陈安安卷入了前所未有的风波中来。分别隶属东厂和西厂的两大高手杨宇轩（王传君 饰）和柳若馨（姜妍 饰）相继潜入天和医馆，在钩心斗角、尔虞我诈的同时，也衍生出一段有一段剪不清理还乱的儿女情长戏码……

改编自山内麻里子的同名小说，聚焦同样在都市生活境遇却截然不同的两个女子——门胁麦扮演生于大城市、被呵护长大的大小姐榛原华子，正全身心投入相亲；水原希子扮演从小地方来东京打拼，自己拼出一条活路的时冈美纪。

青木由里（新垣结衣饰）是一名艺术学校的美术生，因为姐姐结婚而不得不离开原来的住所搬到公寓独自居住。初来乍到的由里听从母亲的建议带着礼物拜访公寓每一位新邻居，对住在楼上的奥优高司（松田龙平饰）印象深刻。后来由里来到林业部门实习发现，原来自己要跟随的教授竟然就是住在自己楼上的高司。在和高司研究松树发光的课题期间，青木由里渐渐喜欢上了这个沉默寡言的男生。因为将送给姐姐的礼物遗忘在老居所，青木由里又认识了新搬来的住户建筑师君太暑子（菊地凛子饰），受到君太暑子欣然微笑的椅子的启发，还设计出了自己即将参赛的让两个人更亲近的椅子。由里本以为这两段美好的友谊是新生活的开始，然而一块剪掉的窗帘让她意外的知道了原来奥优高司和君太暑子曾是一对恋人，而自己现在的住所正是君太暑子以前住过的地方。就这样由里陷入了一段纠结的三角关系中。

　　有一天，太阳的恩惠，也就是光变得微弱下来了，这可是大事件，这样下去，不可思议星将没有光，成为黑暗的世界！根据传说，为了让太阳的恩惠回到世界，需要只有太阳之国的公主才可以使用的魔法“prominence”。但是，能够拯救星球那样强力的prominence只有一名合格的公主才能够发动。

　　卡美拉与卡欧斯决战后的冬天，北海道降下流星雨，其中一颗坠落在支笏湖南西方约一公里处，陆上自卫队第11师团随即派出化学防护小队，渡良瀬佑介二佐与花谷陆尉深入调查，发现到了是陨石坠落。　　五天后，事件的原凶开始现身，札幌市地下铁的电车在隧道内被不明生物攻击，北海道札幌市的薄野出现巨大植物，巨大植物窜出一群体长3m，类似昆虫的甲壳类生物。　　怪虫(Legion)与植物是与流星一起飞来的地球外物体，两者属共生关系，Legion会借由啃食硅酮并分泌氧气来制造植物(草体)，在这种高浓度氧的环境下，地球生物绝对无法生存，自卫队决定用爆破处理草体。此时海上自卫队探测到卡美拉往札幌飞去........

　　1999年，长峰博士在赤道附近发现了加欧斯的变异种，同时候在日本西南方的海中发现了卡美拉的墓场。　　时间回到1995年的东京，因为加欧斯来袭，比良坂绫奈一家人准备离开东京，此时卡美拉受到加欧斯的攻击而落下，在卡美拉起身时破坏了绫奈的家，而绫奈的父母来不及逃出。目睹父母身亡的绫奈，从此开始憎恨卡美拉....　　时间再拉回到1999年，居住在乡下亲戚家的绫奈饱受同学的欺负，有一天绫奈被同学叫到供奉一个东西叫做"柳星张"的神社，同学要绫奈将里面的东西给搬出来，此时世世代代守护着柳星张的守部家成员守部美雪见到此状，于是偷偷的去告知自己的哥哥龙成，龙成便到神社将绫奈的同学赶走，此时绫奈把东西搬出来，龙成便要求绫奈把东西给搬回去，但是在绫奈搬走东西的原处，两人发现了一个奇怪的东西，两人见状便吓得逃走，到了晚上，那个东西出现了变化，里面出现了一个东西...　　而在此同时，加欧斯出现在东京涩谷上空，没多久之后一阵爆炸声，加欧斯被击中，并且坠落在涩谷车站，此时卡美拉从空中降落.....

　　1936年上海滩，爱国组织成员黄伟杰接到除掉协助日本黑商走私鸦片马会长的任务，巧遇爱国商人冯冠宇竟是儿时挚友。阔别多年再见面却剑拔弩张，只因冯冠宇在年少时失约导致黄伟杰差点被日本浪人打死。冯冠宇因心中亏欠，想要修复友谊弥补心结。在冯冠宇的强势手腕下，黄伟杰被迫成为其保镖。虽然两人矛盾不断，但在一次次共同患难中，二人重拾兄弟情义。随着日本侵华的涌现，怀揣着正义理想的两人，携手共抗，英勇投身爱国主义事业。虽然黑夜已至，但黎明和曙光亦在前方。

　　顺利升入高中的少年富樫勇太（福山润 配音）在初中时代曾是暗黑系的中二病患者，当年他自称黑炎之主人，自我感觉良好地度过了无厘头的中学生活。但是此刻他“痛改前非”，将这段经历看作不堪回首的耻辱过去，为此甚至不惜报考一个离家很远没有人认识自己的高中。在新的学校，勇太如愿以偿结 交了一色诚（保志总一朗 配音）、丹生谷森夏（赤崎千夏 配音）以及学姐五月七日茴香（浅仓幸美 配音）这样稍显正常的朋友，也准备和心仪的女孩大谈一场浪漫恋爱。但是令他备为挠头的是，楼上新搬来的住户兼同班同学小鸟游六花（内田真礼 配音）却是一个中二病的深度患者。小女孩每天唧唧歪歪，怪力乱神。好不容易摆脱初中阴影的勇太，高中恋爱之梦日渐飘渺……

富士见市某经营热带鱼的商店，居住着社本一家三口。户主信介（吹越满 饰）在妻子去世后不久便娶了美丽的妙子，此举令女儿美津子大为不满，因此家中的气氛总是压抑凝重，妙子更是小心翼翼，生怕因自己惹出事端。某晚，美津子因在行窃被超市所扣留，社本夫妇匆忙前往，多亏热情的陌生男子村田幸雄出面方得以脱身。村田也是一家热带鱼商店的老板，他诚恳地邀请社见一家到他的店中做客，并愿意聘用美津子为职员。社本夫妇虽有些无所适从，却不自觉地被村田牵着鼻子走。不久后，村田邀请信介为合作人，结果竟在信介的面前杀死了一个质疑自己的男人。一向唯唯诺诺的信介，被迫成为了疯狂的村田毁尸灭迹的帮凶……

　　友川橙花（松本穗香 饰）遭遇了爱情和事业上的双重打击，心灰意冷的她失去了对于生活的热情。回到阔别已久的老家，橙花参加了母亲的三周年忌日，哪知道走进家门，看到的竟然是男扮女装的父亲青治（板尾创路 饰），青治告诉橙花，自己即将再婚了，而再婚的对象，竟然是一个名叫藤田和生（浜野谦太 饰）的男人，不仅如此，和生还有一个正在念高中的女儿。　　橙花完全不能够接受父亲的决定，在这个节骨眼上，向来不按常理出牌的弟弟跳了出来，表示完全支持父亲的选择，不仅如此，他还决定帮他举办一场盛大的婚礼，而老家的乡亲们，似乎都接受了青治的选择。