故事描述未解决案件专门部门—警视厅特命搜查对策室，透过文书搜查官一文一武的搭档对案件档案上文字解读来破案。

刘健一（金城武饰）是新宿歌舞伎町的混混，身为台湾与日本人的残留孤儿，混血的他被叫作半唐番，不为社会所容纳。歌舞伎町有着上海帮、福建帮、北京帮、台湾帮等，各方力量形成复杂的角力形势。年关将至，似乎是因为健一的前度拍档吴富春（椎名桔平饰）返回歌舞伎町，他因杀死元成贵（曾志伟饰）的手下而逃亡，元成贵遂限令健一在三日内交出富春，否则二人便只有死路一条。此时左藤夏美（山本未来饰）出现，她称与有过节，为了活命甘愿出卖一切，健一被她吸引。富春终于现身，偷袭元成贵的情妇黄秀红的夜总会“上海滩”，令健一陷入绝境。所有人都劝他离开歌舞伎町，但真相并不是那么简单，命运并没有眷顾二人……

14岁那年，美丽可爱的女孩小泽理央（佐佐木希 饰）经历了人生前所未有的变故，在此之后她自甘堕落，和相熟好友们依靠援交和诈骗聚敛金钱，光鲜亮丽的外表下，掩饰不住内心莫名的绝望与空虚。一个意外，让理央邂逅了和自己同姓的大学教师小泽光辉（谷原章介 饰）。光辉那英俊正直又略显呆板木讷的外表和气质刹那间攫住了理央的心。她被阴云笼罩的灵魂仿佛被光辉发自内心的灿烂光芒驱散，她渐渐喜欢上这个大男孩。然而光辉始终无法全心全意投入恋情，因为数年之前，他已被诊断患有恶性肿瘤，留在人间的时间所剩无几……

一起发生于丰后关前藩的意外，让磐音失去了两个发小。伤心的磐音决意离开家乡，于是告别了未婚妻奈绪，成为了一名漂泊无主的武士。磐音在江户的一间长屋中开始了自己的新生活，经屋主金兵卫的介绍，磐音白天在鳗鱼店...

时值龙腾世纪，大地处于一种神秘而阴森的氛围之中。安卓丝蒂教会是当时万众信仰的归属，为了阻止邪恶自私的血魔法师滥用魔法，危害人间，教会严格禁止人民是用魔法，更组建了圣殿骑士负责追查澧清各种可以分子。在这一过程中，腐败罪恶不断滋长，世界愈加黑暗。十年集会将至，信众从四面八方赶到奥莱桑帝国。在此重要时刻，血魔法师蠢蠢欲动，酝酿着更大的阴谋。　　拜伦所率领的圣殿骑士展开更为缜密的追查，而屠龙一族的女子卡珊德拉也参与其中。阴谋、罪恶混杂其中，拜伦发现，即使来自身边的人也变得不那么可靠，这群忠心耿耿、勇猛无敌的骑士面临前所未有的挑战……