《苍蓝钢铁的琶音剧场版》讲述士官候补生千早群像和同伴们偶然登上了旧时大日本帝国海军的潜水艇“伊401”后发生的故事。男主角千早群像担任“伊401”的临时舰长，女主角伊欧娜则是“伊401”的拟人化形态。

作品主要讲述了某天，一款掀起大热潮的VRMMORPG「YGGDRASIL」原本会停止一切服务，但即使过了结束时间，玩家也不会退出游戏，NPC也有了各自的思想。现实世界中喜爱电玩的主人公铃木悟（真名）在等待系统强制登出时，与“安兹·乌尔·恭”公会的成员意外穿越到了异世界，并且自己还变成了拥有骷髅外表的最强魔法师——“飞鼠”。就这样，真正的奇幻传说正式拉开帷幕。

葛西舞（足立梨花 饰）和诗乃（江野泽爱美 饰）曾是就读于同一所学校的同学，之后，因为父母工作的原因，两人双双从热闹繁华的大都市东京转学到了位于宁静乡间的高中内就读。在原来的学校里，小舞扮演者霸凌者的角色，而性格内向懦弱的诗乃就是她霸凌的对象。来到了新的学校后，这样的关系似乎发生了逆转。　　因为同情诗乃曾经的遭遇，小舞成为了众矢之的。每天在学校里备受无视忍气吞声生活的小舞，在忍无可忍之中决定不听朋友们的苦心劝告，对诗乃和班上同学们的欺侮展开反击。作为曾经的“恶魔”，小舞有怎样的计划呢？