经历了一番波折，曾经的暗黑系中二深度患者富樫勇太（福山润 配音）终于和现役中二中毒者小鸟游六花（内田真礼 配音）确立了恋爱关系。因妈妈出差和爷爷的失误，六花暂时借住在勇太家中，二人开始实质的同居生活。转眼他们升入了高二，青春气息鄙人的校园内，一色诚（保志总一朗 配音）换了新的发型，丹生谷森夏（赤崎千夏 配音）发誓君临校园，凸守早苗（上坂堇 配音）和阿森的爱憎对决依然继续，变成三年级的“残念生”五月七日茴香（浅仓幸美 配音）则冷感继续。　　美好的季节里，好朋友们再度聚首，可爱、有趣、浪漫又感人的故事继续上演……

　　残酷的地下格斗继续进行着。　　王马第一战虽然赢了，但接下来就要面对吴之一族的强悍对手。王马将要如何杀出重围？

　　滑头鬼，是统领着百鬼夜行的妖怪总大将。十三岁的奴良陆生（福山润 配音）看似是一名普通中学生，喜欢着同班同学家长加奈（平野绫 配音）。但其实他有四分之一的妖怪血统，是大妖怪“滑头鬼”的孙子。他被 “奴良组”众妖怪尊称为少主，身边有个叫及川冰丽（崛江由衣 配音）的亲信。但他一心只想当一个普通人类，不肯承认自己是妖怪的事实，更不愿继承奴良组三代目之位。　　四年前一次意外，使他觉醒了妖怪之血，暂时恢复了妖怪的相貌，但是到了白天，他又变回了人类的模样并且还会忘记自己是妖怪这件事。自此以来，奴良陆生仍过着平静的人类生活。但其实自觉醒之日起，他便已经立下志愿要继承奴良组三代目，站在众鬼之巅，成为魑魅魍魉之主。

　　小晴（爱河里花子 配音）自幼和母亲维达（茂吕田香 配音）生活在热闹闲散的热带雨林中，虽然母亲孩子气的性格经常给小晴制造出不小的麻烦，但这两人之家的生活尚且温馨快乐。这一天，醉醺醺的维达不知从哪里带回了一个浑身都散发着粉红色气息的可爱少女——阿布（渡边菜生子 配音）。　　热带雨林里的众人都很喜欢这个可爱的少女，但只有小晴知道，在阿布的“商用”表情背后，藏着一张眼神犀利的阴沉脸，随着脸孔的转变，其乐观开朗的个性也会变得异常腹黑。阿布千变万化的个性让小晴吃了不少的苦头，但小晴也明白，这正是阿布特有的，“关怀”他人的方式。对于小晴来说，有了阿布，从前平静无聊的生活再也不会复返了，一个充满着刺激和冒险的未来在等着他，也在等着热带雨林里的老老小小。

小学生小晴与未婚妈妈维达两个人快乐地住在热带雨林里，过着简单而欢乐的生活。一天，酒醉夜归的维达带回来一个美丽的小女孩，她叫阿布。本以为将更加快乐的生活，却在第二天开始了翻天覆地的改变。小晴发现，昨晚的阿布完全是伪装出来的。实际上，阿布不仅脾气古怪，爱捉弄小晴，并且还有一个什么都能吞噬的胃。而小晴从未谋面的爸爸，似乎也要来到这个热带雨林。充满爆笑与不可思议事件人物的热带雨林，因为阿布的到来，而变得与众不同起来。

　　帝国军经亚布迪克门冲战一役，歼灭了统合体军的主要战力，幻炎作战更替为打扫残敌和开辟领土的狩人作战，拉菲尔和津特，因为贵族的身份，被派到某颗行星上暂代领主一职，而这颗行星竟是统合体用作监狱之用，上面的监狱管理人员和囚犯门派林立，危机看似一触即发...　　本片是《星界的纹章》续作，剧情取自小说《星界的战旗》第一部和第二部。　　这段剧情是现今全部星界小说的高潮部分，大量的舰队空间战充斥其间！男女主人公的感情也越发清晰。其他次要人物也各有相当的发挥，可谓精彩纷呈、好戏不断！　　[世界背景]　　在距今遥远的未来，人类的足迹已经遍及数不尽的星系。这些庞大繁杂的星系，绝大多数隶属于两大阵营：亚布的人类帝国、人类统合体。亚布帝国在国力与星系规模上凌驾于统合体。他们的扩张并非为了土地！而是为了拥有广阔星际空间的控制权。他们称自己为：星界的眷族。　　亚布人有着不同于普通人类的外表和社会生活习惯：蓝色的头发、不分男女皆有的美丽容貌、二百多年的寿命、轻盈且适合宇宙生活的体态、松散的家庭关系等等，而那些被他们征服的星系，其下一代也会因为基因的操作，而逐渐被同化为真正的亚布人。　　这个种族的起源是因为“原古”时期，刚刚脱离地球圈的人类为了向外太空探索，改造了人类基因，诞生出适应太空生活的人类。至于亚布究竟是如何拜托控制，一步步成为跨越数个星系的大帝国，就是后话了。　　[关于小说]　　星界系列的全部中文版小说已经由台湾尖端出版社出版发行 (不包括外传等)。　　小说和动画的直感上有不少差别，即使你看过动画多次，仍旧会因小说的情节而感动。　　小说目前共计有六部正传：　　《星界的纹章》3部 (改编成动画《星界的纹章》)　　《星界的战旗》3部 (第1部改编成动画《星界的战旗》，第2部改编成动画《星界的战旗II》)

表面上，花菱薰（保志总一朗 配音）是一个普通的少年，但在年幼时，薰有着非常悲惨的身世。薰的父亲是声名显赫的花菱财阀的掌门，而母亲只是一介平民，为此，母亲受了不少的苦，甚至遭到了逐出家门的无情命运。为此，薰一直耿耿于怀，最终选择离开了庞大的家族独自生活。　　这天，一个名叫樱庭葵（川澄绫子 配音）的女子来到了薰的身边，原来，葵是薰的青梅竹马，从小就结下了婚约。由于薰的离开，花菱家取消了薰和葵的婚约，而葵此行的目的，就是为了当面向薰询问消息的虚实。被葵的真情打动，薰和葵开始了他们的同居生活，一段让人津津乐道的爱情佳话就此展开。

故事发生在名为“风祭”的都市之中，天王寺瑚太朗（森田成一 配音）是一名平凡的高中生，过着风平浪静的生活。一年一度的收获祭即将到来，这个热闹欢快的祭典让整个城市都陷入了欢乐而躁动的海洋之中。　　瑚太郎接受了一份寻找新闻线索的工作，于是开始了在城市各处的奔走，在此过程中，只存在于都市传说之中的怪奇事件和神秘生物渐渐浮出了水面，与此同时，瑚太郎的身边亦发生了许多令他百思不得其解的怪事。为此，瑚太郎找到了超自然研究会的会长千里朱音（喜多村英梨 配音），希望后者能够解答他的疑惑，哪知道在两人调查的过程中，瑚太郎的一干好友纷纷被卷入了风暴之中。

　　為迎接機動戰士鋼彈SEED十周年的2012年，官方於2011年8月26日啟動「HD Remaster Project（高畫質再製企劃）」，畫面尺寸比將從原先的4：3升級為16：9寬螢幕，線性PCM音源化，部分音樂採用混音版，局部畫面的替換和修正，各特效與背景的處理變更，並整合特別版三部作以及「DESTINY」的賽璐珞片，再編輯為全48話，收錄至Blu-ray共四卷BOX販售。相較於過去其他鋼彈作品的Remaster僅是單純的高畫質化，本作有著更全面的提升。「機動戰士鋼彈SEED HD」於2011年12月23日起在BandaiChannel針對日本國內進行限定放送，TV方面則於2012年1月1日起在日本BS11播映。gundam.info同時提供附有簡體中文(已不再提供)、繁體中文、英文和韓文字幕影片的網路配信。愛奇藝將本作命名為「機動戰士高達SEED HD Remaster」於2011年12月23日11時起播出。

C.E.70年2月，地球联合军与ZAFT之间的武装冲突由于“染血的情人节”悲剧而全面升级为地球圈规模的战争。C.E.71年6月，在“非我即敌”的观念驱使下，地球联合军悍然发动了对中立国家奥布联合酋长国的侵略。当战斗进行到最激烈的时候，少年真飞鸟失去了父母和妹妹。唯一的遗物就只有妹妹掉落的手机。获救之后，背负着家仇的真黯然离开了故土奥布前往PLANT。两年后，他成为了ZAFT的战士......